然而，无论是盖亚，还是阿赖耶，都没有想到的事，她们原本只是想要守护这个是世界建立的英灵之座，甚至还不惜代价的将之移动到世界外侧，让它从这个世界的时间束缚中解脱出来的这一举动，在更好的守护了这个世界的同时，却也为这个世界带来了更多的麻烦。
首先，因为英灵之座游离于这个世界的时间之外，不受世界的时间线束缚，使得不同的时代人们，都可以沟通英灵之座召唤出英灵，而这些被召唤的英灵们，却又偏偏都来自于不同的时代，如果只是召唤出了古代或者是架空世界的英灵还好说，但是，未来的英灵也可能会被召唤出来，当他们被召唤出来之后，就会在过去留下未来的名号，这就导致了一个个时空悖论的产生，从而引发了时间线的混乱，更有甚至，在远古时代被留下了未来的科技，或者说，一些能够影响人类进程的大人物，知道了自己的历史轨迹之后，并想要将之更改。
这些混乱的时间线被世界记录了下来，从而又导致了许多虚假错乱的历史产生，而这些错乱的历史所引发的动荡，甚至足以更改整个人类文明的进程，这个结果自然也是有好有坏，好的结果可能会让人类变得更加繁荣了，而坏的结果，则可能导致人类在未来被灭绝了，甚至于连星球，都有可能被影响到。
而且，随着这些英灵的乱入和时间线的混乱，使得盖亚对神秘力量的封锁也出现了漏洞，有的人类借助着英灵的力量，成功沟通了他们本不应感知到的根源之地，窃取了被盖亚封印在那里的魔法知识，从而在神秘力量不断消褪的大环境下，再度诞生出了一些拥有超凡之力的人类，这些人类中，甚至于还包括了五个成功领悟出涉及了世界根源法则魔法的，这种超乎常规的不合理存在，而根据这五个人领悟魔法的先后顺序，这五种涉及了世界根源法则的魔法，则被冠以了第一魔法到第五魔法之名。
因为这种根源魔法足以对世界产生巨大的影响，在发现这个情况之后，盖亚和阿赖耶及时出手，制止了根源魔法知识的扩散，具体手法嘛，无非就是通过威逼利诱等手段，和领悟了根源魔法的存在签订锲约，让他们成为这个世界的守护者，将他们的力量和知识用于守护世界，并且不准将这份力量再传授出去，当然，五个人里面也有不同意的，结果自然是被盖亚和阿赖耶给抹消掉了。
虽然盖亚和阿赖耶的行动很果决，没有让根源魔法扩散出去，可是有关根源魔法的消息，还是被传了出去，包括如何沟通根源等等，这自然引起了无数人的觊觎，掌握着根源魔法的几个存在，无一不成了众人追逐的对象，只不过，因为和盖亚以及阿赖耶签订的严密契约，他们也不可能将这力量传授出去。
问题出现在了第三魔法的领悟者上面，所谓的第三魔法，也就是灵魂物质化魔法，换言之，就是可以随时用魔力构筑肉体或者是躯壳，同时又将灵魂化身为永动机一样的存在，拥有着无穷无尽的魔力，可以不停地构筑出各种物质，达到另一种意义上的不死不灭的魔法。