“小智，你明天一定还要来”拉迪亚斯拉了拉小智的手。
“好的，我会在这座城市逗留几天”小智摸了摸她的脑袋。
“拉迪亚斯真的很喜欢小智”看到拉迪亚斯亲密的碰触着小智的脸颊，卡侬这时说道。
“不过天色黑了，我也要回神奇宝贝中心了，免得我的伙伴担心，下次，我在找你玩”虽然小智也舍不得拉迪亚斯，不过自己出来一天了，也需要回去，避免小刚他们担心。
“我们走吧”随后老爷爷带着小智向外走去。
“这里是…”走出来后，就直接进到了一个工作室里，小智好奇的看着四周，和原来的地方不一样。
“是我的工作车间，修理船只的工厂，空闲了，就到博物馆去当导游帮忙，卡侬，你带小智回神奇宝贝中心吧”
“对了，在白天我见到拉迪亚斯的时候，正有两个坏人在抓她，肯定不怀好意，你们一定要小心”小智这时想起白天的事情，提醒卡侬和老爷爷道。
“是这样啊”老爷爷听后若有所思，随后小智就在卡侬的帮助下回到了神奇宝贝中心休息。
“小智，你去哪里来了，那么晚才回来”回到神奇宝贝中心，就看到瑟蕾娜他们在等小智。
小智便把今天的事情告诉了他们，他们听了都很吃惊，打算明天和小智一起去看看。吃过晚饭，瑟蕾娜他们很快进了梦乡，而小智也在擦着神奇宝贝球，今晚注定是一个不眠之夜。
就在大概凌晨时分的时候，小智发现有人从窗户进来了。
“拉迪亚斯”拉迪亚斯看到小智后变成人类的样子，扑到了小智的怀里，开始哭诉起来。
“怎么回事”瑟蕾娜他们被拉迪亚斯的哭声吵醒了。
“不用担心，拉迪亚斯，他们是我的伙伴”小智安抚受惊的拉迪亚斯。
拉迪亚斯听到小智这么说也放下心来，变回原来的样子，它现在只相信小智一个人。
拉迪亚斯的样子先是吓了他们一跳，不过想起今天小智和他们说的事，很快接受了一个事情。
“我长话短说，刚才有两个人把拉帝欧斯、博物馆老爷爷和卡侬给抓走了，心之水滴也被抢走了，拉帝欧斯拼命挡住那两个人的攻击，拉迪亚斯才跑出来的”小智解释道。
“呜~~~~”就在这时拉迪亚斯的眼睛发出亮光。
“是梦境投影”看到四周的影像发生了变化，小刚说道，“是博物馆的大厅”
“是卡侬”随后就看到卡侬和老爷爷被阿利多斯的丝线绑在了一旁。
“是那两个人，还有心之水滴”小智随后发现就是白天那两个想要抓拉迪亚斯的人，心之水滴也被放在了博物馆的那个机器上，随后莉奥就启动了机器。
“化石翼龙和镰刀盔”随后就看到博物馆地板上的化石翼龙和镰刀盔的化石被复活了，小刚非常的惊讶。
“我们快走”看到四周恢复了原样，小智知道时间紧迫，所以就说道，然后大家就向外跑去，乘着卡侬的船向博物馆而去。
“不好，是镰刀盔，它的眼中只有眼白，是被控制的”刚走了不久，就看到镰刀盔从水里冒了出来，“这里交给我，你们快走，去吧，大岩蛇”小刚主动留了下来，派出了自己的大岩蛇来阻住这只镰刀盔。
“赫拉克罗斯，你也去帮忙。小刚要小心啊”小智非常的相信小刚，派出赫拉克罗斯一起去压制镰刀盔，就再次向前而去。
刚走没多久，小智他们这边则是再次碰到了麻烦，“这次是化石翼龙，这次我来，牛蛙君，去吧”看到是化石翼龙来袭，小霞跳下船，派出了牛蛙君来迎击。
“叶精灵你也去吧”瑟蕾娜也派出叶精灵阻拦化石翼龙。
“好了，你们快走吧”小霞和瑟蕾娜一起挡住化石翼龙。
“那是…”就在小智和拉迪亚斯感到广场的时候，就看到一道水柱冲天而起，向着广场而来。
“应该是莉奥控制那个机器引起的”小智随后说道，“快走”而后就向前跑去。
“不好”不过他们再跑也没有水流快，水流迅速就把他们围了起来，卡侬担心的说。
“比雕电光一闪带我们离开”小智看着逐渐向他们压来的水流，放出比雕说道。
“啊~”经过一路险阻，小智、拉迪亚斯终于到了博物馆，一走进博物馆，就看到那个巨大的机器底下发出许多能量，仿佛失控了，在到处乱转，拉帝欧斯则被困在一旁的铁圈中，老爷爷和卡侬被绑在一旁。
“太阳精灵”站在底下的桑兰看到小智他们后，就对太阳精灵说道，想要阻拦小智。
“皮卡丘，不用留手，十万伏特”小智则是没时间和她耗，皮卡丘直接一道电流打过去，命中了太阳精灵、阿利多斯和桑兰。
“皮卡丘铁尾”小智趁着这个时候来到了老爷爷和卡侬身旁，皮卡丘用铁尾切断丝线解救他们。
“机器已经失控了”老爷爷被解救下来后说道。
“这样下去，拉帝欧斯会死的”随后卡侬看到困住拉帝欧斯的铁圈开始不断的加速，快速的吸收拉帝欧斯的能量，担心的说。
这时拉迪亚斯也来到了拉帝欧斯的身旁，不断的撞击着困住拉帝欧斯的铁圈，不过完全的没效，小智立刻走过去，扶起刚才被铁圈弹开的拉迪亚斯。
“拉迪亚斯，让我来”小智阻止拉迪亚斯继续撞击。
“出来吧喷火龙”小智放出了喷火龙。
小智拿出mega进化石，丢给喷火龙，然后自己拿出项链。
“喷火龙mega进化”
“吼————”
mega进化链条出来，双方互相交融，黑色的mega喷火龙出现了。
“喷火龙使用龙之冲锋，皮卡丘，对着喷火龙使出最大威力的十万伏特”随着小智一挥手，喷火龙全身龙形能量包裹全身，皮卡丘释放出强大的电流迅速包裹喷火龙。
“去吧”
两大技能融合在一起，让喷火龙全身被金黄色的能量包裹，朝着铁圈冲过去。
“轰——”
一声巨响，铁圈完全被撞的变成一团麻花掉在地上，喷火龙飞了出来，全身散发着反噬的电流力量。
“拉帝欧斯，没事吧”拉帝欧斯终于解困了，小智和拉迪亚斯立刻跑上去担心的问道，而那边的机器也因为没有了拉帝欧斯停了下来，桑兰也跑去看莉奥了。
“呜———”拉帝欧斯气息奄奄的趴在地上。
“小智，没事吧”小霞他们这个时候也终于赶来了。
“啊呀，怎么整个都变色了”就在这时桑兰看着心之水滴说道，原来水蓝色的心之水滴，变成了红色，而且中间还有好多的黑斑。
“不要碰”老爷爷看到桑兰想要碰心之水滴，于是立刻阻止，可是还是晚了，桑兰已经碰到了，随后就被心之水滴发出的能量给弹开了，接着心之水滴就爆破开来，变成了碎片，而那个机器则是再一次的失控了，而且比刚才还严重。
“当坏人使用心之水滴时，心之水滴会出现裂痕最后消失，和这个城市一起”老爷爷解释道。
“什么”听到这个城市也会消失，小霞吓了一跳。
“大海…消失了”拉帝欧斯稍微恢复了后，大家走出博物馆，就看到大海渐渐的退去，最后完全的消失了，露出了裸露的河床，看到这一幕，大家都非常的不敢相信。
“是海啸”就在这时，小刚指着远方的海平面惊呼起来，滔天巨浪席卷而来，城市在它看来是多么的渺小，而对小智来说自己在灾难中的力量是多么的微弱。
“城市要沉了”看到这么大的海啸，老爷爷抱着害怕的卡侬说道。
“小智，怎么办”小霞这时也着急的看着小智，在她看来经历了那么多的磨难，都是小智一个人能决绝，本能的一种依赖。
“呜呜呜———”这时拉帝欧斯和拉迪亚斯叫了起来，然后就要向前冲去。
“等一下，拉帝欧斯，拉迪亚斯，请你带我一起去”小智说到，他知道现在只要靠他们的力量才能拯救这座城市了，而且一定要用心之水滴来平衡大海的力量。但他实在是不想让拉帝欧斯牺牲自己来弥补人类犯的错误。
拉迪亚斯迷蒙的看着拉帝欧斯，而拉帝欧斯却摇摇头，拒绝小智的要求，带着拉迪亚斯冲了上去。
“喷火龙”小智大喊到，喷火龙马上飞过小智面前，小智将皮卡丘丢下去，不让它跟过来。
“皮卡丘~”（小智，你要干什么！）
跟了小智那么久，它当然知道小智的想法，但是现在想追过去却很难，小智已经骑着喷火龙飞走了。
“呜———”随后拉帝欧斯和拉迪亚斯使出力量变成巨大的光球冲了过去，直接进入了海啸中，随后一点亮光急剧的膨胀，覆盖了整个海啸，光亮慢慢的弥散，照耀着海水上，海水渐渐的平复了下来，再次回归到了平静，而后巨大的光亮快速的缩减，成一道光柱直达天际。
小智就趁这个机会冲进了光束里面，他在里面看到一个蓝色的世界，这里完全不受重力影响，小智完全可以飘着。拉帝欧斯上方出现一个朦朦胧胧的蓝色的小球，那就是准备全新完成的心之水滴。
不过看到拉帝欧斯痛苦的表情，这恐怕正在抽取它的生命和灵魂。
“喷火龙现在命令你带拉帝欧斯和拉迪亚斯离开”小智回头对喷火龙说到。
“吼~”（主人那你呢？）
“我不用你管，还有不要回来接我，这是命令”小智对喷火龙怒斥道，小智很少对神奇宝贝发脾气，就算自己受到它们的攻击也只是一笑而过。
喷火龙看着小智的怒斥，只能不情愿的带着拉迪亚斯和拉帝欧斯离开这里。
小霞他们看到喷火龙带着虚弱的拉帝欧斯和拉迪亚斯回来，却没有小智的身影。
“小智呢？快告诉我小智呢”瑟蕾娜对着喷火龙怒吼到。
喷火龙什么也没说，看着那道冲天的光束。
“什么…小智还在那里”这是候大家也知道喷火龙想表达的意思，但现在根本没办法过去，只能默默为小智祈祷。
在光束里，小智看到失去拉帝欧斯力量支持的心之水滴正在弱小，好像要消失一样。他取下了项链，将项链紧紧握在手里，其实他也没有把握，但他在赌，赌赢了皆大欢喜，赌输了即便付出自己的生命，小智也要拯救这个城市，拯救拉帝欧斯。
想起洛奇亚说的话，小智摊开手里的项链，缓缓说到“如果你真的能帮我解决困难，那就把你无所不能的力量借给我吧！我想拯救这个城市，不想看到人类犯下的错误要用神奇宝贝的生命来弥补，我宁愿用自己的生命来承受所有的后果”
项链微微一动，似乎是回应小智，开始散发出蓝色的光芒，自己的波导力量和大量蓝色的气息涌现出来，不断注入心之水滴，心之水滴又开始继续成型，最后形成一个完整的心之水滴。
“太…好…了”在心之水滴完成的那一刻，小智非常高兴，但是他感觉自己非常累，累的眼皮都有点打不开了，一手握着项链，一手拿着心之水滴，在光束消失后，微笑的掉了下来，扎进了冰冷的海水里。
“快看，大海”这时小霞指着海面说道，然后大家就看到海水慢慢的朝着水都而来，把裸露的河床慢慢的覆盖，所有的巷道再次被海水所充填，城市又恢复了原来的样貌。
“你果然还是做出这个决定，看来我没有看错人”昏迷中的小智突然感觉自己脑海里听到了古老的声音。
“真是一个不计后果的人，不过这样的人我喜欢”另一个声音出现在小智的脑海里。
“他的未来充满荆棘和艰辛，这是他的命运，也是我们的幸运”又一个声音说道。
“只要他愿意，我们愿意跟随他一辈子”许多声音同时响起。
这时候小智突然睁开眼睛，不过看到的却是…
“好熟悉的天花板！”
“皮卡~”（小智你醒了）这时皮卡丘的脑袋出现在小智的面前。
“我没事”小智摸了摸它的脑袋，然后把手放倒胸口上，发现项链挂在自己的脖子上才松了一口气。
“哎呀~压死我了”这时候一个人影飞扑了过来，砸在了小智身上。
“小智，我还以为你…你…”拉迪亚斯眼泪汪汪的看着小智，当初她知道小智为了解救自己和城市，差点牺牲掉自己。
“傻瓜！我是不会死的”小智摸了摸拉迪亚斯的脑袋。
“小智，你醒了”这时候卡侬个老爷爷他们也进来了。
“真是非常谢谢你了，你救了这个城市”老爷爷带着卡侬和拉帝欧斯对小智发出感谢。
“没什么，这是我应该做的！我睡了多久”小智缓缓说到。
“一天了，小智”小刚说到。
“那我们要走了！白银大会快要开始了，我要快点拿到最后一个徽章，要不然赶不上了”小智这时候马上下床，突然身体一晃动，差点摔倒了。
“小智，身体还没恢复吧，不要太勉强了，我们在停留一段时间吧”瑟蕾娜看到小智这样担心的说到。
“不，是我肚子饿了”小智这时候摸了摸肚子，他已经少吃了三餐。
“哎呦~”一阵华丽的摔倒声响起，小智尴尬的挠了挠后脑勺。
吃过午饭，小智他们也要告别这里，继续踏上旅程了。
“路上要小心”老爷爷对小智他们说道，“奇怪了，卡侬和拉迪亚斯它们怎么没来送行呢”随后老爷爷有点奇怪的说。
“没事，也许它们累了，在休息呢”虽然小智也有点遗憾没有见到拉帝欧斯和拉迪亚斯，不过还是说道，“那我们走了”
“小智，是卡侬”就在这时，小霞发现卡侬正在朝这边跑来。
“不，是拉迪亚斯！”小智说到，马上停下船走了上去。
“谢谢你，小智”拉迪亚斯跑过来后，就递给小智一张纸，小智打开后，就看到画的是自己还有皮卡丘的样子，看起来非常温馨的一幅画。
随后拉迪亚斯突然靠近小智，亲了小智的脸颊，这让小智呆了一下。
小霞吃惊的忘记了抱住波克比，而瑟蕾娜也惊呆了，小刚一副羡慕嫉妒恨的表情，皮卡丘则是一副小智有出息的表情。
告别众人后小智一行人前往最后一个徽章烟墨道馆的旅途。
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