在大地恍惚之间，艾克斯就已经出现在了一个密闭容器之中了。
作为实验小队的一员，大地在短暂地观察四周之后，立马意识到他和艾克斯，居然被关押在了一个锥形烧瓶之中。
而他们就处在一张实验桌上，周围都是玻璃器皿之类的仪器。
“这里是哪里？”大地有些惊惑地问道。
就在大地正在四处张望的时候，身后传来了脚步声。
“是谁？”大地转身向着身后望去，看到了一只巨大的拿着放大镜的猩猩，正在观察着他。
在大地惊惧的目光中，大猩猩走到实验桌的前面，开始讲述着它的故事。
“我的名字叫M1号，是过去被科技力量所创造出来，而又被人类抛弃的人工生命。”大猩猩蔚蓝色的眼眸猛得一张，关于它的影像就被投影在了半空中。
大地喃喃道：“人工生命？”
艾克斯则有些担忧：“大地，我们现在没时间理它！阿守也有可能被他传送到某个地方了。用赛罗奥特曼的力量，逃离这里吧！”
“好，我知道了！”
大地从腰包之中，取出了虚拟赛罗卡片，准备以空间穿梭的方式，逃离大猩猩的魔爪。但终端机并没有开始读取塞入卡槽中的虚拟赛罗卡片。
“什么？为什么？”这让大地感到十分惊惧和困惑。
“在这里，无法使用那些卡片！”大猩猩回过头，看向在烧瓶中的艾克斯。
艾克斯见到无法使用虚拟卡片的力量之后，就准备以暴力打破烧瓶，来脱离困境。但令艾克斯没有想到的时，无论他使用着多大的气力，都无法打破着看似脆弱的玻璃器皿。
“哥莫拉终于恢复了它本来的样子！”大猩猩催动着念力，悬浮在了半空之中，面前出现了Ex哥莫拉的实时景象，语气越发冷漠：“但是，你们为什么还要夺走它的自由？”
……
神木正太郎：“空战马斯凯迪使用梵顿光子炮，作威胁攻击，以此限制它的行动！让阿守去制服他！”
隼人：“明白！”
就在艾克斯和大地被大猩猩传送走之后，哥莫拉就钻地前往了最近的一座城市。
尽管海克斯奥特曼和空战马斯凯迪，以虚拟赛罗卡片的力量，在极短的时间内赶到了现场。但哥莫拉仍造成了不可预计的破坏。
明日奈从实验车辆阿拉米斯上下来，拿出终端机对着神木正太郎队长汇报道：“K-5地区的市民已经全部避难完毕！”
“叮叮叮！”是终端机收到紧急信息的声音。
明日奈眯着眼睛听着琉依发送过来的语音：“哥莫拉身上有着实体化粒子，这种粒子会与阿守他们的射线冲突，而产生剧烈的爆炸。所以，并不能通过海克斯奥特曼的必杀光线，将哥莫拉复原！”
明日奈听完之后，便有了决断，立马驾驶着阿拉米斯前进着。
“让我们来阻止哥莫拉吧！”隼人朝着哥莫拉身周的地面，发射出数枚梵顿光子炮，来限制着哥莫拉的行动。
三日月守原本想用虚拟贾戈尔贡卡片，来封锁哥莫拉的行动。但三日月守觉得这张卡片太霸道了，在吉奥基地中实验时，曾将一个靶子真的变成了石头，并且再也变不回来了。
三日月守怕真把哥莫拉变成石头，所以，只能在远处控制着岩石，封锁住哥莫拉的行动。