八月初六天启皇帝召见了东南战役有功人等之后，正如魏忠贤所报，他们当晚在京师醉仙楼庆祝一番之后便是各奔前程。
刘毅于八月十日回到了太平府，和他一起的还有安庆卫的龙宗武，龙宗武在芜湖县城停留一日，和官升一级的黄玉一起去安庆卫，这次东南大战刘毅拿到了安庆卫镇抚使的官衔，实领太平府镇守千总的位子，黄玉也因为分润军功，上调成为了安庆卫实授镇抚使，终于又是向上爬了一级，而且又和自己的老上司碰面了，黄玉上任前对刘毅交代了一番，心下感叹，刘毅才十八岁就拿到了安庆卫镇抚使的官衔，着实是后生可畏。黄玉在任上对刘毅也是颇为照顾，这次调入卫指挥使司，级别比刘毅还要高半级，可以说是顶头上司，所以跟黄玉还有龙宗武继续保持良好的关系是很有必要的，在他们走的那天，刘毅特别准备了一万两白银的会票塞给龙宗武，私下又给了黄玉五千两会票。二人喜笑颜开，连连推辞，刘毅跟他们拉扯了一番才将二人送出城外。但此次周之翰却未得升迁，想必又是阉党从中作梗的缘故吧。周之翰依然是太平府的知州。
此次大战新军损失了不少兵马，所以刘毅在去京师受赏之前就交代刘金，陶宗等人招募新丁，将民团全部补入青弋军，这时候刘毅训练民团的方案就体现出了优越性，民团就相当于预备役部队，除了武器装备以外，训练强度达到了青弋军的一半，在刘金下令征召民团编入青弋军之后，这些民团战士除了没上过战场，技战术不纯熟以外，列阵，走步，纪律等各方面完全能和青弋军并肩。
刘毅既然成为了镇守千总，那么麾下就要开始扩军了。在他回来的第二天整个太平府开始运转起来，军队，府衙，徽商总会开启了宣传机器，在太平府三县招募士兵，目前太平府全府的总人口约有七十万口，十四万户。按照刘毅的安排，募兵分成两条线进行，分为民团和新军，第一步计划扩军至两千四百人，其中新军一千二百人作为刘毅麾下镇守正兵，另有民团一千二百人作为预备役。民团的粮饷由总会提供，标准是新军的三分之一，因为民团在平时还要从事正常生产，所以这些钱粮对于民团的士兵来说是够了。目前就先扩军这么多，民团基本是不受限制的，既然太平府有三个县城，那么以后等钱粮更加充足之后可以进一步扩军，刘毅的设想是能做到每个县城都有一支一千二百人的民团驻扎，这样手上就有一支强大的预备力量了。
在刘毅升职之后，麾下的军将也都升职了，刘金和陶宗升为副千总，晋军和吴东明升为把总，而陈宝和王浩升为镇抚官。
江南制造总局在这段时间内生产了不少二六式火铳和弹药，足以装备更多的士兵，刘毅对军队进行了重新规划，现在的情况来看刘毅麾下已经有了团级编制，那么相应的士兵的功能就要做出更明确的划分。首先以吴东明麾下连剩下的骑兵战士为基础，加上太平府各处马场产出的军马，已经达到了近八百匹，完全可以武装两个骑兵连的骑兵，所以刘毅将整个千总营分为十个连，连长仍是百户。
第一连第二连是骑兵连，有兵员二百四十人，战马五百匹，做到一人双马，装备和以前一样，每人手铳两杆，骑兵长枪一杆，马刀一柄。内衬锁子甲或鳞甲，外罩制造总局最新生产的棉甲，这种棉甲除了外面的铜钉比制式棉甲宽大以外，还加装了更坚固的护心镜，特别是反面内衬复合铁叶，总会的缝衣娘们将铁叶穿孔，然后用粗线将铁叶重叠，一层挨着一层的缝在棉甲的反面，这就相当于不管从哪个角度打击这个棉甲，里面都会是两层铁叶承担这个打击的力量。硬是将骑兵的两层甲赋予了后金巴牙喇兵三层重甲的威力。而重量要小十斤，不要小看这十斤，战场上这就意味着你胯下的战马能比别人多跑十数里，赋予骑兵高防护力的同时还给了更高的机动力，刘毅对此非常满意，所有骑兵全部换装清一色的六瓣笠形盔，取消了钵胄盔。人人戴铁臂护手，配小圆铁盾，六瓣盔的两边有铁制褡裢，护住脸颊耳朵，所有的战马都是批前挡甲。
刘毅硬是将这两百四十名骑兵打造成了铁浮屠，还是装备热兵器的铁浮屠。而骑铳的研制还在有条不紊的进行着，相信再过一年时间，到明年底，骑兵就有趁手的骑铳可以使用了。
第三连成立一个新军种，为医护连，在大明军中也有很多军医角色的存在，可都是东一榔头西一棒槌，每个军营里配备的军医数量也不一致，有就有没有就没有，没有军医的军队里面要是出现了伤病，能到其他军营借到医护人员还好，借不到就只有等死了，整个安庆卫也不过就龙宗武手下有一只担架队，可是那不过是把伤员抬回来，本质上还是需要营中的军医去医治，可是这样会耽误救治时间，很多士兵在路上还好好的，抬回来就因为失血过多死了。所以刘毅特地请中江医馆的王初民王老出山，整编出一只一百二十人的医护连，当募兵告示一贴出来，很多医馆的弟子看到竟然征收医护兵，而且待遇比普通士兵高两倍，只要粗通医理便可，立刻有很多人报名，刘毅将他们一股脑的收编成立了医护连。
这些医护兵在医护技能上交由王初民训练，但同时也要具备战术技能，他们的盔甲装备和普通士兵一样，只不过不带长兵器，只配腰刀一柄，手铳一杆。身背药箱。专门负责在战场上紧急救治伤员。这支部队虽然不是一线战斗部队，但在日后的战斗中涌现出许多可歌可泣的战斗英雄。
第四连是炮兵连，制造总局从年初开始仿造红夷大炮，佛郎机等火炮，并且利用工坊的蒸汽动力一次成型钻炮管，跟铳管的原理一样，做出的炮管大小一致，可靠性很好，内壁光滑，耐高温性更好，不像各地官军的大炮，每五炮需要散热，青弋军的各式火炮，可以连续打十发，整个炮兵连装备五门红夷大炮，十门佛郎机将军炮，三十门飞雷炮，保证了远中近三层的火力覆盖，飞雷炮既能野战也能攻城，一炮两用。