允熥对他们会反对设立格致院早有预料，当即说道：“儒学虽是正途，是大道，但有道无术也不成。天文历法、数学演算、造船修船、冶炼钢铁、研习火器、钻研医术甚至养马喂马，哪个不需要研究？”
虽然允熥真正想要设立的是科学院，但现在也只能拉出技术来垫背了。毕竟大明的官员对技术还有所了解，对科学则是完全不知所云。至于以后，格致院把门一关谁知道研究什么。
“这只不过是工匠之术，如何能够为他们单独设立一个衙门专司研习这些事情？”已经奏了请求退休的折子但尚未履行完退休程序的宋麟道。
“就算工匠也是为国效力，工部若无那些工匠如何能够做下这许多事情？”允熥反问。
“这，”宋麟对于现在工部除了尚书、侍郎和几个郎中之外的其它官职都是识字的工匠充任很不满意，但毕竟工匠也是为国效力，他也不能对此说什么，只能说道：“即使如此，将除研习天文历法之外的人划归工部，即能研习这些事情，又能节约朝廷的钱粮，岂不一举两得？”
“现下工部的差事已经很多，如何能再兼顾这些？”允熥说道：“不过这确实是工部份内之事，就划归工部管着，但仍旧为一单独的衙门。”
“陛下，若是划归工部管着，那品级就有些高了，不如降为五品。”吏部尚书李仁出言道。
“可。”允熥答应。
既然允熥退步，说得也在理，众官员也就不再反对设立格致院。
允熥也松了口气。对他来说，只要这么个衙门设立了就行，至于品级高低与什么名头倒不重要。就算划归工部，工部尚书也不是没眼力见儿的人，敢随意插手么？
等下了朝，允熥马上派人将曹徵叫来，在自己平日里批答折子的前殿对他与杨士奇吩咐了有关格致院的许多事情，包括衙门设立在哪里、如何开展工作、如何招揽人才，又吩咐杨士奇与曹徵商议格致院内的官制如何设立，回头报给自己。
杨士奇顿时明白皇上这是表明自己对格致院的重视，让他们不至于生出自己被贬镝的想法。是的，他们。内阁现在这么多中书舍人、通事舍人，杨士奇平日里勤奋肯干，从没出过纰漏，虽然并非与所有舍人的关系都好，但要是无缘无故的被分到冷衙门，也会寒了人心。人心散了，队伍就不好带了，对此很明白的允熥自然不会让这样的事情发生。
至于为何挑选杨士奇当这个主官也是有门道的。现在他身边的这些中书舍人，杨士奇、杨溥、金善、王艮等人资格是最老的，理应从他们中间挑选；而这些人中杨溥、金善、王艮都是进士出身，恐怕看不起格致院，只有杨士奇连秀才都没中过，还因为家里穷曾经四处漂泊，不至于鄙视格致院的科学工作者。
将此事吩咐完毕，允熥又把王艮、杨溥、金善三人叫过来笑道：“若不是最近的会试殿试，朕也想不到你们几个已经到朕身边三年了。”
“这三年来你们在朕身边为官，票拟奏折议论政事，比之刚刚考中进士时沉稳许多，朕也可以放心的委托给你们一些重任。”