方阳并没有逃出去，他刚出了长安城门便被羽林军追上，押解回城。皇帝为了澄清这件事，将他交予三司会审。
方阳对于谋刺长沙王之事供认不讳，是他暗暗地差人监视长沙王动向，也是他安排的刺客，行刺的目的就是为了方家一族报仇。
他在审判现场大骂樊崇，说他当初投奔青州军时，樊崇答应了会助他复仇，可是等到进了长安，樊崇便将许诺抛在脑后，他只有自已动手，可惜时运不济，未能得手。
樊崇得知后大怒，他一直待方阳如上宾，对他信任有加，没想到方阳竟如此对他。他已助方阳推翻了更始皇帝，至于刘玄的生死，在于建世皇帝，与他何干？方阳如此怪他，竟当着众人的面辱骂他，简直岂有此理。
樊桃花道：“父亲，您错怪方先生了，他明着是在骂你，其实是在帮你。”
“他把我骂成这样，还帮我，桃花你是不是糊涂了？”
“你才是真糊涂！”樊桃花道：“方阳是你府中的家丞，他有罪，你也脱不了干系，甚至很多人怀疑你也参予此事，听说有个唐御史一直在追问方先生是受谁主使，你说他是指谁？”
“我怎么能。。。这个姓唐的真是混蛋！”
“方先生当众骂你，正是要脱了你的干系，方先生用心良苦，可是父亲却并不领情。”
“这么说他是为了我好？”
“也不全是为了你，或许是为了他的儿子，他还指望着你帮他照顾儿子呢！这可是他方家唯一留下来的独苗。”
方家当年因为方阳的兄长方望扶立孺子婴，起兵造反，被刘玄灭了族。只有方阳侥幸逃了出来，投靠了樊崇，之后他又娶了妻，生下一个儿子，如今刚满三岁，就养在樊崇的府中。
樊崇沉默了半晌，说道：“你这么一说，还真是这么回事儿。方先生是聪明人，竟想到这样的主意为我脱罪。唉！可惜！”
樊崇嗟叹半晌，又道：“方先生以后事相托，是信得过我樊崇，我樊崇不才，一定会将他的儿子养大成人。”
樊桃花道：“这得先看陛下的意思，看他是不是罪止方先生一人，不再累及其家人。”
“方先生行刺事出有因，他为父母兄弟报仇，何罪之有？何况那刘玄又没伤着半根毫毛，以方先生一人抵罪还不够，怎么还要难为他的孩子？”
樊崇说着霍地站起，“我去跟皇上说！他不能让方先生绝后！”
“父亲！”樊桃花拦住了他，“您如今哪都不能去！不仅不能去求情，反而要上书请罪，自请责罚。”
方阳的案子没多久就定了下来，事情很清楚，没什么政治背景，也没什么阴谋，完全是方阳的个人复仇行为。
这个案子在朝臣中引发了广泛争议，有人主张依法处理，判处方阳腰斩之刑，有人却说他的刺杀行为是为父母复仇，是尽孝道，大汉以孝治天下，应当法外施恩，将方阳赦免。